Es posible que aparezcan en nuestro cultivo hongos parásitos. Normalmente la aparición de estos hongos es producida por un desequilibrio relacionado con la humedad. La ubicación del huerto es un factor muy importante en cuanto a las posibilidades de aparición de hongos, hay lugares que por su alto grado de humedad y precipitaciones son mucho más propensos que otros.

Estos son algunas de las enfermedades criptogámicas y  hongos más comunes que pueden aparecer en nuestro huerto y las técnicas para controlarlos: